Stiftelsen Bryggen, opprettet 1962 for å stå som juridisk person ved eiendomskjøp i forbindelse med den redningsaksjonen foreningen Bryggens Venner tok på seg. Den er eier av omkring halvparten av bygningsmassen mellom Nikolaikirkeallmenning og Radisson SAS Royal Hotel. Stiftelsen har også stått for rehabilitering og vedlikehold av bygninger, bl.a. Pütterstuen. Ved siden av styret har stiftelsen et råd sammensatt av faglig ekspertise og folkevalgte politikere. Den mottar offentlige tilskudd fra Riksantikvaren, Bergen kommune og Hordaland fylke.